蘭化所毛細管柱利用色譜柱先將混合物分離，然后利用檢測器依次檢測已分離出來的組分。色譜柱的直徑為數毫米，其中填充有固體吸附劑或液體溶劑，所填充的吸附劑或溶劑稱為固定相。與固定相相對應的還有一個流動相。流動相是一種與樣品和固定相都不發生反應的氣體，一般為氮或氫氣。待分析的樣品在色譜柱頂端注入流動相，流動相帶著樣品進入色譜柱，故流動相又稱為載氣。
蘭化所毛細管柱分類與檢測器的連接
在毛細管連接到檢測器之前，先接通載氣，看一下柱子的出口是否有載氣通過，（將柱子出口浸進凈水中看是否有氣泡出現）假如沒有載氣從柱子出來，說明柱前的系統中有的地方漏氣或柱子堵塞，應找出原因加以解決。然后將柱子的未端盡可能的伸到檢測器（FID）的噴嘴以下的1~2厘米處（但不能超過噴嘴，并使柱子的出口處于氣流的高流速區域（即氫氣引進口以上），假如柱子不能直接伸到檢測器的噴嘴下1~2厘米處，但必須伸到尾吹氣進口的上部使柱子的未端處于氣流的高速區域。
蘭化所毛細管柱與進樣器的連接
對于分流進樣，毛細管柱的進口端一定要伸過分流進樣器的分流出口，亦就是使毛細管柱的進口處于載氣的高流速區域。假如毛細管柱的進口在分流進樣器的分流出口以下，處于載氣的低流速區域，得到的色譜圖還不如填充柱，所以必須將毛細管的進口伸過分流進樣器的分流出口，這樣才會得到尖銳的峰形。對于分流/不分流進樣，毛細管的進口應接到進樣器的底部，這樣可以使汽化管中的樣品*進進柱子，也不會出現氣流清洗不到的“死區”。
